Le diagnostic biologique : S'il est en train de se renforcer rapidement, notamment grâce au réseau des Instituts Pasteur qui constitue un dispositif de laboratoires de référence performant, il est encore faible voire inexistant au niveau des laboratoires de microbiologie qui se trouvent à proximité des grands services de Maladies Infectieuses appelés à prendre en charge les cas suspects. Or il est essentiel d'avoir un laboratoire hospitalier efficient pour une prise en charge adaptée et rapide des patients, en complément des services de référence. Les autorités sanitaires souhaitent que l’optimisation du diagnostic soit incluse dans les activités de ces laboratoires en cas d'épidémies explosives et de besoin rapide de résultats. Dans ce contexte de transition épidémiologique du paludisme et d’augmentation de fièvres non palustres, il est par ailleurs important de renforcer le diagnostic des infections virales en général.