Les approches de l’analyse géographique, des SIG, de la cartographie et de l’analyse spatio-temporelle sont complémentaires aux approches épidémiologiques et à la surveillance des épidémies. Cette nouvelle formation vise donc à compléter les webinaires de formation en épidémiologie de terrain réalisées dans le cadre du projet APHRO-CoV.
Ce nouveau module de formation, financé par l’ambassade de France au Burkina Faso, a été créé par AFENET et l’IRD.
Cette formation sera composée de webinaires et de sessions en présentiel. La partie webinaire sera accessible à l’ensemble des pays du projet APHRO-CoV (Burkina Faso, Côte d’Ivoire, Gabon, Mali, Sénégal). La partie en présentiel, consacrée à la pratique avancée de méthodes d’analyses spatiales et de modélisation et nécessitant des séances de tutorat et d’accompagnement, se déroulera au Burkina Faso (des sessions similaires pourront être réalisées dans les autres pays, sous réserve de financement).
Ce projet vise à former et renforcer les capacités des agents des Ministères de la Santé et des CORUS en géo-épidémiologie.
Programme des enseignements :
Les sessions d'enseignement se réaliseront tous les mercredis de 14h à 16h (GMT), via l'outil de visio-conférence GoToWebinar (pour la partie webinaire), et au centre IRD de Ouagadougou pour les agents formés en présentiel.
04/11/2020 - M. Altmann, E. Bonnet- Apports de l’analyse spatiale à l’épidémiologie de terrain (M. Altmann, J. Gaudart)
- Cartographie : règles et méthodes (E. Bonnet)
- Introduction aux Systèmes d’Informations Géographiques
- Prise en main de QGIS 3.10
- Manipulation de bases de données géographiques
- Edition cartographique simple
- Interrogation et requête sur les bases de données géographiques
- Importation et jointures de bases de données
- Mise à jour de bases de données (calculs, ajouts de points GPS, digitalisation)
- Apport de l'analyse spatiale et des SIG dans la surveillance sanitaire
- Intégration et exploitation d'images satellite
- Intégration et utilisation de données Open Street Map
- Import/export Google Earth
- Mise en page cartographique avancée
- Géotraitements (buffer, densités)
- Matrices de distances
- Export vers des logiciels de modélisation et de statistiques
- Apport de la cartographie à l'épidémiologie de terrain
Matériel pré-requis :
Tous les apprenants devront installer sur leur ordinateur personnel :- un logiciel de tableur (Excel ou OpenOffice Calc)
- le logiciel QGIS 3.10 téléchargeable à ce lien : https://www.qgis.org/fr/site/forusers/download.html (NB : il est important de télécharger la version 3.10, disponible sur Mac, PC et Linux)
Les formateurs :
- Mathias Altmann (épidémiologiste - ISPED - Université de Bordeaux)
- Emmanuel Bonnet (directeur de recherche - UMI Résiliences - Centre IRD de Ouagadougou)
- Jean Gaudart (Université Aix-Marseille, Inserm, IRD, SESSTIM UMR1252 - Faculté de médecine, Marseille)
- Marianne Kouawo (Coordinatrice de terrain, Programme de formation en épidémie de terrain - Université Joseph Ki-Zerbo, Ouagadougou)
- Boukary Ouedraogo (Directeur des Systèmes d'Information en Santé (DSIS) - Ministère de la Santé du Burkina Faso)
